合金弹头A除了系列作品中常见的分支路线之外，本作还特别增加了GBA版独有的隐藏关设定，当玩家在游戏中达成一定条件时，隐藏关就会开启，大大增强了游戏的探索性。
游戏简介
本作充分发挥了GBA的机能，虽说是掌机上的游戏，但是从游戏的画面、音效、手感以及火爆程度方面都是原汁原味的继承了街机合金弹头系列的传统风格，并且增加了GBA版独有的系统，保证能让广大合金FANS们满意。
游戏背景
实际游戏中，《合金弹头》系列那幽默的画风依然得以保留。本作在很多关卡都再现了系列作品的经典场景，三代的海滩与丛林，二代的矿场，一代的山路，五代的古墓……看到这些似曾相识场景，配合着节奏感强劲的背景音乐，绝对让玩家热血沸腾。除了系列作品中常见的分支路线之外，本作还特别增加了GBA版独有的隐藏关设定，当玩家在游戏中达成一定条件时，隐藏关就会开启，大大增强了游戏的探索性。
游戏操作
本作的操作与街机版相同，分别是射击（近身攻击）、手雷和跳跃。与街机版比较，本作人物只有一次生命，但是却有体力的设定。受到攻击之后不再是一击毙命而是扣血，根据角色受到的伤害不同扣血量也不同。在中途捡到的食物类道具（例如烤鸡、蘑菇、面包、罐头之类的）可以补充角色的体力。这样的设定从一定程度上降低了游戏的难度。游戏可以无限接关，但是一旦中途丧命接关时，不像街机版就地复活，而是从玩家所在章节的起点处重新开始。
收集要素
合金弹头A中最吸引人的就是收集要素。它不同于街机版中仅仅是对人质的收集。由于是掌机版的缘故，本作取消了原有的分数系统，取而代之的是卡片和人质的收集。人质的收集与系列作相同，可以救出普通人质和隐藏人质。有些人质会藏在隐藏的房间、过道甚至地下迷宫中。人质的收集完成度可以在每关过关后的人质花名册上查看。

卡片的收集则是本游戏的最大亮点。作为GBA版独有的卡片系统，卡片的效果在游戏中起到了极其重要的作用。包括可以提升坦克的防御力或者弹跳力的卡片，可以提升武器装弹量或者武器威力的卡片，可以帮助探索隐藏道具以及人质的卡片，还有开启特殊游戏模式以及变换骑乘武器等五花八门的卡片。卡片的收集方式也是多种多样：除了救出人质，获得道具，打每关固定的隐藏点可以收集卡片之外，还有很多卡片需要独特的方式才能收集到。比如在限定时间内杀每关BOSS可以得到特殊卡片，救出N名人质之后可以得到纪念卡片等等。最关键的是某些隐藏路线和游戏的隐藏关只有在获得特定卡片之后才会开启。本作通关不难，难就难在把卡片集齐。游戏一旦中途接关，在本关的接关点之前所获得卡片将会消失，之前努力付之一炬。只有在保证不接关的情况下，从一关的开头打到关底才能保留本关内获得的卡片。以下为卡片获取关卡及条件：

第一关：

普通卡片：114457616263646667

需要收集卡片后得到的：1827

第二关：

普通卡片：0313152026324558707478

第三关：

普通卡片：01081733374671

需要收集卡片后得到的：020416243641565975

第四关：

普通卡片：05101422252829344760657276

第五关（收集卡片至少3次通过）

普通卡片：0609121921233031353839404849557377

附加关DUNGEON(得到上一关的55号卡片后进入，路线较复杂，大致分为3部分)

第1部分07424351

第2部分505368

第3部分525469

特殊卡片收集：

通过杀敌数量得到：86878889

通过拯救人质得到：90919293949596979899

未杀敌就被OVER得到：85

使用04号卡片功能后（开启后按L键发动）得到：84

特定BOSS特定时间击破：7980818283

收集齐前99张卡片后得到：100

BOSS卡片得法

第一关10秒内干掉boss

第二关90秒内干掉boss

第三关20秒内干掉boss

第四关15秒内干掉boss

第五关：80秒内干掉boss