1996年。这一年也招开KOF大会。不过这一次与以前的神秘大会不同，是由巨大企业赞助支持的世界规模的盛会。

在世界各地的选拔赛脱颖三神器在这里终于全部出现了，即将开始封印工作。不同魅力的角色在这里纷纷登场出现。而出的队伍加上KOF常驻队伍组成令人吃惊的超强阵容。其中有在过去曾未谋取世界霸权的克劳撒、BIG，以及鲁卡尔的秘书维丝、玛卓与京的宿敌八神庵组队。

作为正式大会举办的KOF’96难道有什么不为人知的内幕?苦斗之后，大会的主办者神乐千鹤站到了优胜者面前。在证明了优胜队的实力后，她请求帮助一同去封住被解放出的大蛇一族的力量。

于是优胜队与大蛇一族的高尼茨开始了战斗，战败的高尼茨自己结束了生命……

但是与大蛇一族的战斗才刚刚开始，强有力的敌人会在下次大会中出现。

KOF’96的系统较前作变动很大。以前的攻击闪避(及反击攻击)变更为紧急回避动作，游戏的速度感大幅提高，这使得对战成为高速高反应的对决。

能量条MAX时和防守反击时可使用紧急回避动作，另外，在体力条变红并且能量条MAX时的超必杀技变强，另外还有许多的超必杀的出招画面和动作也会有许多变化。

还有，加入了飞行道具和无敌必杀技的性质变更因素，这一要素一直保持到现在还没有改变。在打击防御技的新系统中，攻防的变化更加多样。

值得一提的是，在系统中设定了各主角的相性及相互克制，这也是不可忽视的战略要点。