《梦幻之星 便携版2》以“SEED事件”三年之后的世界为舞台，讲述格兰尔星系由于面临资源枯竭问题，而不得不利用“亚空间航行理论”向外宇宙进发，而故事也就此拉开序幕……

　　与前作相比，《梦幻之星 便携版2》在游戏的各个方面都进行了不小的进化，不仅角色造型焕然一新，还增加了紧急回避、蓄力射击、防御盾牌等新动作、新道具，其所搭载的“基础结构模式”支持多人通过网络连接同时进行游戏。